Eiseres heeft beroep ingesteld tegen het besluit van het college van Gedeputeerde Staten van Zeeland tot ambtshalve wijziging en aanvulling van een watervergunning uit 1959 voor grondwateronttrekking in het waterwingebied Sint Jansteen.
De rechtbank oordeelt dat verweerder onvoldoende rekening heeft gehouden met de natuurwaarden in het waterwingebied, onderdeel van het Natuur Netwerk Zeeland. Verweerder heeft nagelaten een adequaat onderzoek te verrichten naar de effecten van de gewijzigde vergunningvoorschriften op de natuurwaarden, terwijl het gebied sinds 1959 is aangewezen als natuurgebied en klimaatverandering de omstandigheden heeft gewijzigd.
De rechtbank stelt vast dat de gewijzigde voorschriften leiden tot een andere maximale onttrekking en nieuwe monitoringsverplichtingen, maar dat niet is onderzocht of deze onder huidige omstandigheden significante schade aan de natuur veroorzaken. Ook is onvoldoende gemotiveerd of en hoe de natuurwaarden worden beschermd bij afwijkingen.
De rechtbank wijst erop dat de Wet natuurbescherming niet rechtstreeks onderdeel is van het toetsingskader van de Waterwet, maar dat handhaving van natuurbescherming via andere wegen kan plaatsvinden. De rechtbank vernietigt het besluit en stelt een termijn van zes maanden voor verweerder om het onderzoek alsnog uit te voeren en de vergunningvoorschriften te motiveren. Daarna volgt een einduitspraak.